MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_9p

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018886	A	7	7	8	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018886	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018886	AT	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018886	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
5	NC_018886	TGAG	2	8	192	199	25 %	25 %	50 %	0 %	410683890
6	NC_018886	AGA	3	9	264	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
7	NC_018886	GGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683890
8	NC_018886	GAT	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683890
9	NC_018886	AAAG	2	8	388	395	75 %	0 %	25 %	0 %	410683890
10	NC_018886	T	7	7	402	408	0 %	100 %	0 %	0 %	410683890
11	NC_018886	GAC	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683890
12	NC_018886	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683890
13	NC_018886	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683890
14	NC_018886	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
15	NC_018886	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683890
16	NC_018886	ATT	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
17	NC_018886	AAG	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
18	NC_018886	AAG	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
19	NC_018886	GTC	2	6	918	923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683890
20	NC_018886	AATT	2	8	924	931	50 %	50 %	0 %	0 %	410683890
21	NC_018886	ATT	2	6	943	948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
22	NC_018886	A	6	6	962	967	100 %	0 %	0 %	0 %	410683890
23	NC_018886	GAAT	2	8	1009	1016	50 %	25 %	25 %	0 %	410683890
24	NC_018886	ATT	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
25	NC_018886	TAAT	2	8	1119	1126	50 %	50 %	0 %	0 %	410683890
26	NC_018886	TAT	3	9	1172	1180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683891
27	NC_018886	A	6	6	1212	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	410683891
28	NC_018886	A	7	7	1274	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	410683891
29	NC_018886	ATT	2	6	1286	1291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683891
30	NC_018886	GTTG	2	8	1348	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	410683891
31	NC_018886	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018886	TAA	2	6	1393	1398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018886	ACTG	2	8	1403	1410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018886	TTATT	2	10	1430	1439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018886	GCA	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018886	T	7	7	1477	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018886	TTAAAT	2	12	1509	1520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018886	ATTT	2	8	1536	1543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018886	AT	3	6	1561	1566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018886	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018886	T	7	7	1628	1634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018886	AT	4	8	1639	1646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018886	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018886	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018886	T	7	7	1677	1683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018886	T	6	6	1731	1736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018886	GATTT	2	10	1743	1752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018886	TCTTT	2	10	1808	1817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018886	TA	3	6	1847	1852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018886	A	6	6	1878	1883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018886	TG	3	6	1950	1955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018886	TTG	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018886	T	6	6	2001	2006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018886	A	6	6	2075	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018886	AT	3	6	2109	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018886	AT	3	6	2117	2122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018886	ATG	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018886	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018886	A	6	6	2172	2177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018886	A	6	6	2185	2190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018886	T	6	6	2199	2204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018886	TTTA	2	8	2212	2219	25 %	75 %	0 %	0 %	410683892
63	NC_018886	TC	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	410683892
64	NC_018886	TTA	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683892
65	NC_018886	AATA	2	8	2375	2382	75 %	25 %	0 %	0 %	410683892
66	NC_018886	TTTG	2	8	2390	2397	0 %	75 %	25 %	0 %	410683892
67	NC_018886	T	6	6	2409	2414	0 %	100 %	0 %	0 %	410683892
68	NC_018886	T	7	7	2500	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018886	TA	3	6	2545	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018886	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018886	AT	3	6	2614	2619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018886	AT	3	6	2649	2654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018886	A	6	6	2655	2660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018886	ATT	2	6	2671	2676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018886	GTAA	2	8	2710	2717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018886	TGAA	2	8	2732	2739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018886	GTA	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683893
78	NC_018886	ATA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
79	NC_018886	TAA	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
80	NC_018886	TCT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683893
81	NC_018886	AT	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	410683893
82	NC_018886	GAT	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683893
83	NC_018886	AAT	2	6	2977	2982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
84	NC_018886	ATG	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018886	T	8	8	3066	3073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018886	TAG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018886	TGA	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018886	T	7	7	3283	3289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018886	TA	3	6	3359	3364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018886	AAAAT	2	10	3413	3422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018886	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
92	NC_018886	ATT	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
93	NC_018886	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683894
94	NC_018886	AGA	3	9	3581	3589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
95	NC_018886	TAT	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
96	NC_018886	A	6	6	3676	3681	100 %	0 %	0 %	0 %	410683894
97	NC_018886	AC	3	6	3698	3703	50 %	0 %	0 %	50 %	410683894
98	NC_018886	T	6	6	3710	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	410683894
99	NC_018886	TAT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
100	NC_018886	GCAT	2	8	3742	3749	25 %	25 %	25 %	25 %	410683894
101	NC_018886	AGA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
102	NC_018886	TGA	2	6	3824	3829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683894
103	NC_018886	TAT	2	6	3870	3875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
104	NC_018886	TCA	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683894
105	NC_018886	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
106	NC_018886	T	7	7	3926	3932	0 %	100 %	0 %	0 %	410683894
107	NC_018886	AC	3	6	3976	3981	50 %	0 %	0 %	50 %	410683894
108	NC_018886	AGA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
109	NC_018886	TAA	2	6	4046	4051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683894
110	NC_018886	TCT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683894
111	NC_018886	AAG	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
112	NC_018886	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
113	NC_018886	ACAA	2	8	4229	4236	75 %	0 %	0 %	25 %	410683894
114	NC_018886	AT	3	6	4250	4255	50 %	50 %	0 %	0 %	410683894
115	NC_018886	ATAC	2	8	4400	4407	50 %	25 %	0 %	25 %	410683894
116	NC_018886	GAA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
117	NC_018886	GAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
118	NC_018886	TTA	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
119	NC_018886	ATG	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683894
120	NC_018886	A	6	6	4535	4540	100 %	0 %	0 %	0 %	410683895
121	NC_018886	ACA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683895
122	NC_018886	TTTTC	2	10	4581	4590	0 %	80 %	0 %	20 %	410683895
123	NC_018886	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683895
124	NC_018886	ATG	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683895
125	NC_018886	A	7	7	4629	4635	100 %	0 %	0 %	0 %	410683895
126	NC_018886	ATT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683895
127	NC_018886	CAA	2	6	4646	4651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683895
128	NC_018886	CAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018886	ATT	2	6	4716	4721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018886	TAT	2	6	4754	4759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018886	AAT	2	6	4768	4773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018886	A	7	7	4798	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	410683896
133	NC_018886	GA	3	6	4813	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	410683896
134	NC_018886	A	7	7	4840	4846	100 %	0 %	0 %	0 %	410683896
135	NC_018886	GGA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683896
136	NC_018886	AAT	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
137	NC_018886	AAC	2	6	4930	4935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683896
138	NC_018886	ATA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
139	NC_018886	TC	3	6	4957	4962	0 %	50 %	0 %	50 %	410683896
140	NC_018886	GAA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683896
141	NC_018886	TA	4	8	5034	5041	50 %	50 %	0 %	0 %	410683896
142	NC_018886	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683896
143	NC_018886	TAA	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
144	NC_018886	ATG	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683896
145	NC_018886	ACA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683896
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.